Les découvertes sous-marine qui ont initié « Osiris, Mystères engloutis d’Égypte » sont le fruit du travail de l’équipe de l’Institut Européen d’Archéologie Sous-Marine [ IEASM ] dirigé par l’archéologue sous-marin Franck Goddio. Une équipe internationale qui intègre divers domaines de compétences : Archéologues, égyptologues, plongeurs, numismates, céramologues, savants, spécialistes de la restauration et de la conservation des pièces archéologiques, ingénieurs électroniciens, techniciens, cameramen, photographes… Au total, une trentaine, parfois même une cinquantaine de personnes, Français, Égyptiens, Anglais, Américains, Allemands, Espagnol, Philippins, et Russes travaillent aux côtés du directeur des fouilles. L’équipe se retrouve en principe deux fois par an, au printemps et à l’automne, à bord du bateau-support, le Princess Duda, pour prospecter et fouiller les sites de la baie d’Aboukir à Thônis-Héracléion et Canope.
Le Centre d’archéologie maritime d’Oxford (OCMA) participe aux fouilles avec des étudiants de troisième cycle et leur offre ainsi la possibilité de consacrer leurs recherches au matériel archéologique des fouilles de l’IEASM grâce à l’octroi de bourses de PhD. L’OCMA supervise également la publication scientifique de tous les études résultant des fouilles.
L’ensemble des fouilles est placé sous l’égide de l’IEASM (Institut Européen d’Archéologie Sous-Marine) une association loi 1901 fondée par Franck Goddio en 1987, et sous la haute autorité du Ministère égyptien des antiquités d’Égypte, qui supervise toutes les fouilles dans le pays.